生物处理技术是目前最为成熟的污水处理技术，且其处理效果较为稳定，处理成本低.生物法主要是通过微生物代谢作用降解污水中的有机污染物，目前应用比较多的是UASB以及UASB组合工艺.杨可成研究用水解酸化调节池+UASB+SBR工艺处理金黄色素废水，进水COD为2.8～16.5g/L，SS的质量浓度为600～1550mg/L，属高含量制药废水，处理后的出水COD小于1g/mL，COD去除率稳定在80%以上.介绍了升流式厌氧反应器处理制药废水的工程实例，处理效果较好，但是，由于其有机物成分复杂，限制了反应器的HRT，而理想的出水效果需要较长的HRT。具体联系污水宝或参见http://www.dowater.com更多相关技术文档。
利用微生物的生命活动来代谢废水中的有机物，从而达到净化目的，是目前制药废水广泛使用的处理技术，它包括好氧法、厌氧法及它们组合方法.由于单独的好氧处理和厌氧处理都有一定的弊端，而厌氧-好氧的组合工艺在改善废水的可生化性、耐冲击性、投资成本、处理效果等方面表现出了明显优于单一处理方法的性能，因而在工程实践中得到了广泛应用.另外，近年发展起来的膜生物反应器(MBR)为膜分离技术与生化处理有机结合的新型废水处理工艺，通过膜分离技术大大强化了生物反应器的功能，具有容积负荷高、抗冲击能力强、剩余污泥量少、出水质量好、占地面积小等优点，是具应用前途的废水处理新技术之一。
