深圳市环境科学研究院（原深圳市环境科学研究所）成立于1987年，是深圳经济特区成立初期创建的科研机构。经过20多年的发展，目前已成为综合性的环境科学研究机构，是深圳市环境科学研究的主力军与主战场，是深圳市人居环境委员会的重要技术支撑机构。
目前共有员工98人，其中博士15人、硕士58人；高级以上职称36人、中级职称40人，15人拥有国家注册环境评价工程师资质；拥有建设项目环境影响评价甲级证书、废水污染治理工程设计甲级证书、生活污水污染治理设施运营资质证书。自成立以来，我院已经完成了近50项科研项目，多项成果获奖；研究开发的高效垂直流人工湿地技术获得了国家专利，在全国范围内得到广泛应用。
深圳市环境科学研究院位于深圳市红桂路红桂一街50号环保大院，是一家专注于环境保护的高新技术企业。作为专业的环保公司，始终以中国的环境保护事业为己任，竭诚致力于环保服务事业，综合实力在全省同类型企业名列前茅。深圳市环境科学研究院成立以来，已经取得国家环保部颁发的污染治理设施运营资质证书，具体为：2011年获得工业废水甲级资质，有效期为2014年07月；2010年获得生活污水甲级资质，有效期为2013年05月；2010年获得工业废水甲临资质，有效期为2011年05月。