重庆市环境保护工程设计研究院成立于1984年6月，是我市第一批进行科研事业机构转制的单位，已由事业单位改制为重庆市环境保护局控股的有限责任公司。2002年8月19日，注册为重庆市环境保护工程设计研究院有限责任公司。
我公司于2003年5月15日与深圳市开宝庆福投资有限公司、北京大学深圳深港产学研环境技术中心、深圳市京华庆福环保有限公司联合，组成了一个由清华、北大等知名院校专家教授指导的集环保污染治理、设计、环境科学技术研究、咨询为一体的环境保护产业集团。经重庆市工商行政管理局批准，更名为“重庆市环境保护工程设计研究院有限公司”，注册资金3000万元。
重庆市环境保护工程设计研究院有限公司位于重庆市江北区红石路8号，是一家专注于环境保护的高新技术企业，注册资金3000万元。作为专业的环保公司，始终以中国的环境保护事业为己任，竭诚致力于环保服务事业，综合实力在全省同类型企业名列前茅。重庆市环境保护工程设计研究院有限公司成立以来，已经取得国家环保部颁发的污染治理设施运营资质证书，具体为：2011年获得工业废水乙级资质，有效期为2014年09月；2008年获得工业废水乙级资质，有效期为2011年04月。