产后治理即末端治理，主要是对畜禽粪尿进行资源化、无害化处理。目前有关产后治理方法的研究主要侧重于各种畜禽粪尿处理方面，主要有物理处理法、物理化学处理法、化学处理法和生物技术处理法。由于物理处理法只能初步处理污水，而对分离出的固态粪便则多采用无防渗、防淋失设施的露天晾粪场处理，粪便的理化特征改变较小，这种方法处理效率和去除率低，而化学处理法存在二次污染问题，故实际中应用较少，目前研究最多的就是以生物处理法为主的混合处理法。
适合禽畜养殖废水的产后生物处理方法有：
厌氧处理方法
好样处理方法
堆肥处理方法
自然处理方法
在实际应用中，一般视具体情况，以以上几种方法为主体并结合其他处理方法进行优化组合，资源化、无害化和运行费用低廉化应是养殖废水处理的首要原则。
