在蛋白质纯化过程中主要用到的膜分离技术多为超滤。超滤技术是具有效率高、能耗低、无相变、无需添加任何化学试剂、操作简便、条件温和等优点的一种膜分离技术，其用于蛋白质分离纯化具独特优势。但是，在蛋白质的浓缩和脱盐过程中依然有需要注意的问题。
超滤技术在蛋白质的浓缩和脱盐过程中的注意问题：
第一，在超滤循环过程中，由于泵和叶轮与料液的摩擦放热作用，料液的温度会逐渐升高，会造成蛋白质分子的损失。因此，料液贮罐应加冷却系统，并安装自动测温及控制系统。
第二，某些酶的辅助因子散失为问题：一些酶含有辅助因子，其分子量小，超滤时易从透过液中排除掉，因而在超滤前或超滤后要添加一定浓度的的辅助因子。
