影响MBR工艺系统运行效果的4个重要指标分别是污泥浓度(MLSS)、COD负荷、温度、pH，对其分别进行分析。1污泥浓度(MLSS)的影响：蔡岚岚等对污水处理厂好氧池与膜池中MLSS的变化及同期COD和NH3-N的去除效果的研究表明，尽管进水水质波动较大，但是MBR处理系统的出水水质非常稳定，对COD和NH3-N的平均去除率分别为91.9%和98.1%。这是因为MBR反应池内维持了较高的污泥浓度，好氧池的平均MLSS为8.4g/L，膜池的平均MLSS可高达10.23g/L以上。随着MLSS的增高，微生物量也就增加，对水质水量的变化适应能力加强，抗冲击负荷能力变强。
2COD负荷的影响：由于MBR出水水质稳定，所以其动力学参数COD污泥负荷和容积负荷随进、出水的COD浓度变化而变化。郑祥等对毛纺废水处理的实验研究表明，在系统运行初期MLSS仅为0.32g/L，污泥负荷高达3.71g/(kg·d)，系统出水COD在15~45mg/L之间，对COD的平均去除率达90%左右;系统运行10d后，MLSS升至0.9g/L，COD污泥负荷降至1.40kg/(kg·d);系统进入稳定运行期，COD污泥负荷一般在0.60~1.80kg/(kg·d)之间，此时出水的COD值<25mg/L，对COD的平均去除率92%。在系统的稳定运行期，由于进水COD的波动而污泥负荷曾一度升至5.85kg/(kg·d)，但出水水质和各项指标的去除率并无大的变化，表明MBR系统具有较强的抗冲击负荷的能力。具体联系污水宝或参见http://www.dowater.com更多相关技术文档。
3温度的影响：温度对微生物及其酶的活性都有很大的影响，温度的改变不仅影响生化反应的速度和平衡等，而且还影响微生物及其酶系统的种类，从而产生不同类型的生化反应。邵文妹对MBR运行效果的影响因素的实验研究表明，膜生物反应器中，只要污泥浓度在3600mg/L以上，污泥浓度的高低不再是缓冲低温对MBR处理效果的影响因素，反而高污泥浓度的反应器，当温度由低温恢复到25℃左右时，NH3-N和TN的去除率下降，并且NH3-N的去除率恢复也很慢。温度对有机物的去除影响不是很大，因为城市污水处理中一个基本的基质去除机理，是活性污泥对悬浮状态和胶体状态的有机物的“捕集作用”，它是一个一般不受温度影响的物理现象。低温下的氨氮去除率为41.63%~61.86%，说明低温对氨氮的去除有很大的影响，这是因为在低温下，硝化细菌和亚硝化细菌的活性很低，硝化能力不强造成的。
4pH的影响：在MBR工艺中，pH的降低，对COD的去除率影响不是很大，但对NH3-N的去除率影响很大。江军对制药、制革混合废水的脱氮效果研究表明，在活性污泥正常生理活动的pH指范围内(6.5~8.5)，当MBR膜池的pH控制在7.0~8.5之间时，好氧硝化菌与异养硝化菌的生长受到抑制;当pH控制在6.0~7.0之间时，这两种硝化细菌生长良好，特别是当pH控制在6.0~6.5之间时，这2种硝化细菌生长最为旺盛，氨氮的去除效果最好。
